故事发生在炎帝、黄帝所在的蛮荒时代。正值群雄逐鹿中原之际，天下公认的领袖——神农帝去世，金、木、水、火、土各族群雄皆蠢蠢欲动。波涛暗涌的时代中，少年拓拔野横空出世，在机缘巧合下得到了神农帝临终传承，开始了一段惊心动魄的传奇历程。
斗罗最终战的二十年前，武魂殿曾阴谋一统整个魂师界，吞并所有宗门，七宝琉璃宗首当其冲，陷入危难，骨斗罗带着宗门少主—五岁的宁荣荣请剑斗罗出山相救，于是剑斗罗尘心带上小荣荣踏上了一条生死逃亡路，然而他们所不知的是，这条路的背后竟是一场将会影响斗罗大陆的巨大阴谋……
在一座因为发展秘密科技所以被毁灭的城市里，埋藏着可以让死人复活，让活人永生的巨大力量。这力量诱惑着一群又一群无法对命运释怀的人来到这座城市。他们或厮杀，或沉沦，或终其一生追寻已经触不可及的安宁。那力量则静静看着他们，并默默从中挑选自己的主人。被它选中的人，将决定这座城市外所有人类的命运。
